首先，我们的DNA一半来自父亲，一半来自母亲。然后在我们的DNA上有一些区域存在着被称为串联短重复片段（STR）的结构。同一个STR位置，有些人有10个重复，有些人有20个重复。DNA鉴定就是通过检测20个左右不同位置来区分每个个体。我们假设每个位置有5种不同长度的重复（实际只会更多），检测20个位置理论上有95万亿种可能，相对于目前人口的总数量是富富有余的。
但是对于同卵双胞胎（搞遗传和疾病研究人群的最爱）这样的存在，STR的方法往往不能很好的区分。因为在这种情况下STR的多样性特点消失了，STR鉴定只相当于在两个DNA序列高度相似的个体间选取20个位置，希望能够在这20个位置中找到不同。我们假设同卵双胞胎的DNA相似度为99%（总体肯定会比99%更高，但是我们只考虑改变发生可能性高的区域，99%也差不多），那么随机找20个位置完全一致的概率是81.8%。这就是为什么目前基于STR的法医鉴定手段对于同卵双胞胎无能为力的原因。
不过技术始终是在进步的。科学家们又找到了一种新的标记，称为单核苷酸多态性（SNP）。就是做在我们的DNA上的某个位置，有些人是A，另外一些人是B。 可以看出每个SNP包含的信息量是远远少于STR的，前者只有两种可能，而后者可以有十几种可能。但是SNP存在的数量非常多，检测起来也更加容易，随着 新技术的发展，检测成本和时间都在大幅度下降。
前面我们说了检测20个STR有95万亿种可能性，那么检测200个SNP呢，2的200次方=10的60次方。作为对比我们知道地球上的沙子大概有10的24次方个。这样看来检测200个SNP来区分不同的人会比之前的STR的方法更加可靠。
再回到同卵双胞胎的问题上，同样按照99%的相似度来计算，检测200个SNP后，两个人完全一致的概率为13.4%。虽然不能保证一定区分开，但是要比STR情况好很多。
处女座的朋友又要纠结了，万一我遇到的情况就是在在13.4%里面怎么办？So easy，可以做全基因组测序，一周时间，费用不过是几万元。不要说99%的相似度，就是99.99999999......%的相似度，只要有不一样的地方，就能找出来。
可能还有人问，既然SNP这么好，为什么现在没见到有人用。这就涉及到一个数据兼容的问题，STR作为标准检测手段存在了十几年，已经在全球建立了一个庞大 的数据库。任何新的检测手段如果不能兼容之前的数据库，那么都是很难推广的。好消息是技术的进步终于解决了这个问题，DNA的检测已经可以同时检测STR 和SNP。
对于双胞胎兄弟娶双胞胎姐妹的情况，分出孩子是谁和谁生的也不是问题了。
