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细胞鉴定报告解读

细胞鉴定:人源细胞STR分型检测、小鼠细胞STR分型检测、种属鉴定、支原体检测

STR溯源比对要求:人源细胞与7440个人源STR数据比对;小鼠细胞与74个小鼠STR数据比对;指定细胞或组织相互比对;无(不比对)。

根据国际细胞鉴定委员会(ICLAC)制定的细胞STR鉴定标准,细胞系的匹配度≥80% 时,认为它们具有相关性,即衍生于共同的祖先细胞;匹配度在55% 至 80% 之间,需要进一步验证相关性;小于55%,表明两者不具有相关性。

人源细胞与7440个人源STR数据比对:

比对8个位点-D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、vWA、TH01、TPOX、CSF1PO;(比对未含性别位点)Amelogenin。

匹配度=(所有匹配峰的个数×2)÷Cellosaurus数据库和检测样所有峰的个数。

指定细胞或组织相互比对:

比对20个位点-:D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、D2S441、VWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338、FGA;

匹配率=(检测样本 STR 数据相同的等位基因数×2)÷比对样本的 STR 总等位基因数。

小鼠细胞与74个小鼠STR数据比对:

比对18个位点: 18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3、6-4、13-1、11-2、17-2、12-1、5-5、X-1

匹配度=(所有匹配峰的个数×2)÷Cellosaurus数据库和检测样所有峰的个数。

本检测体系的小鼠细胞STR检测位点参考:Interlaboratory study to validate a STR profiling method for intraspecies identification of mouse cell lines. (June 20,2019)PLoS ONE

种属鉴定:

用种属荧光复合引物 MIX 对动物线粒体 COI 基因进行扩增(参考文献:Species identification in cell culture: a two-pronged molecular approach, In Vitro Cellular & Developmental—Animal (2007)

支原体检测:

样本采用荧光PCR法支原体检测试剂盒进行检测。

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