亲子鉴定位点的筛选步骤：
1、提取全长的基因组DNA，然后用限制性的酶切割全长DNA片段，通过连接酶把限制性的片段连到载体上构成基因组文库。
2、通过特异的串联重复序列的探针杂交筛选基因组文库。
3、对于阳性克隆进行测序。
4、通过铡序结果设计引物及进行位点特异的PCR分析。
5、位点多态性分析。
亲子鉴定位点的筛选原则应该遵循以下几点：
1、筛选的亲子鉴定位点应该是广泛分布于人群中的。
2、重复片段长度为2-6个碱基之间。
3、亲子鉴定位点应具有高度的杂台性，尽量选择种属特异性高的基因座。
各个亲子鉴定基因座位点在染色体上的定位相对较远，基因座位点的重复次数应该是4个核苷酸单位，小于4十桉苷酸单位的重复次数的亲子鉴定位点容易产生影子带确保无连锁，低突变率。
亲子鉴定位点的命名；比如D22S119位点D代表DNA，22指的是第22号染色体，S指单一序列，119指该位点在染色体上的位置。亲子鉴定位点CSFIPO，FCA，及TH01，vWA等按照国际法医遗传学会DNA委员会(ISFH DNA commIssion)的方法对各位点等位基因进行命名，即以核心序列重复的欢数来命名各位点的等位基因。
CSFIPO, FGA, TH01, TPOX, VWA,D3S1358, D5S818, D7S820, D8Sl179, D13S317, D16S539,D18SS51，D21S11，D21S11和性染色体(Amelogenin)是FBI用来进行法医鉴定常用的位点。13个多态性的亲子鉴定位点和一个性染色体基因能够分三次PCR扩增产生14位点的DNA分型图谱。这13个位点被命名为CODIS Loci。为了PCR扩增片段的分离及检测更加的灵敏，加入了5个重复单位的亲子鉴定位点PentaD，PentaE，多态性程度高，而且5个重复单位的片段有较少的影子带(Bacher et al.，1998)。另外北京公司研制的试剂盒增加了D19S433，D16S1043，D2S441、D12S391，D2SL338位点，随着位点数目的增加检测的精确度也随之增加。
