亲子鉴定的报告的咨询意见有：
在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下，支持被检父亲（检材1的留言者）是（或不是）孩子（检材2的留样者）的生物学父亲，在上述基因座中，从遗传的角度已经得到科学合理的确信。
或描述为：
在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下，根据DNA遗传标记分型结果，支持（或不支持）检材1和检材2存在亲子关系。
解读同卵多胞胎、近亲及外源干扰三种需要排除的情况：
1、同卵多胞胎
如果可疑父亲A和可疑父亲B是同卵双胞的话，则用STR分型检测方法检测两者的样本，可以得到两者的DNA数据是完全一样。因此，在生理上，可疑父亲A生育的孩子，跟可疑父亲B在数据分析比对时，肯定也是存在与亲生父亲相同的结果，存在亲子关系。
2、近亲
近亲关系的中心的两者DNA数据比对，因为是近亲，相似的基因可能比较多，也会出现21个基因座位点的检测出现和亲子关系一样的现象。如父亲同侧基因座遗传现象。其21个基因座位点的检测，同父的两个孩子出现父亲同侧基因座遗传的概率为二分一的20次方。如果有纠结这个概率的存在，提供怀疑近亲的那个样本，检测出DNA数据，参与分析亲子关系，用排除法来判定存在的可能性。
3、外源干扰
外源干扰一般是针对提供的样本，采集时没有知情留言者的情况。一般指血痕和口腔拭子的样本。血痕样本一般要求近期没有做过输血手术或是骨髓移植的，以防采集到输血者的样本或是提供骨髓者的遗传基因；口腔拭子样本一般要求吃母乳的小孩，若是刚吃完母乳需要半小时后采集口腔黏膜细胞，因母乳中含有母亲的DNA信息。
以上三种情况，在亲子鉴定咨询意见中，都会作出说明，不管是有还是无，都会写鉴定意见中，足见科学技术的严谨性。
相关评论：
科鉴基因来自北京东城区的客户反馈：输血第二天做的司法亲子鉴定无影响。
2017年做的司法亲子鉴定，大人头天有输血，说是采集口腔拭子，口腔采集也粘些血痕，可能对结果造成影响。当然如果结果是肯定的，结果就是正确的，样本并没有因外源输血造成错位的结果，因本身输血也是少量的。七个工作日结果出来后是亲子关系。近期输血可能对样本有影响，最终没有。因人本人血痕都是自己的，外源输血，也只是血液的一小部分，可能本身就没能到达采血部位。
科鉴基因来自北京西城区的客户反馈：两孩子间的位点比对也都有一个数字是相同的。
2015年做父子三人的亲子鉴定，结果出来后，发现两孩子间所检测的基因座位点都有一个数字是相同的；岂不是跟大人和孩子符合遗传规律的现象是一样的，可两孩子年龄差不多，不可能存在关系的；咨询鉴定中心。原来孩子是近亲关系的，DNA数字很接近，出现都有一个数字相同的可能也是存在的，且报告里面也把需要排除近亲的情况写了进去，结果描述很眼睛。
科鉴基因来自河北廊坊的客户反馈：两孩子的数据是一样的。
2014年做的个人亲子鉴定，自己采集好样本送到北京做的鉴定。结果出来后，鉴定中心的人员说，被检测的两个孩子是不是长得一样呀！感叹！人都没有见着，能知道是一样的。原来两个孩子的数据是一样的，还是双胞胎且是同卵的。
